Perämeren kansallispuisto sijaitsee Euroopan tärkeimmän lohijoen Tornionjoen edustalla. Vaikutusalue ulottuu Kemi-, Simo- ja Kalixjoen vaelluskalakantoihin. Selkämeren kansallispuistoon verrattuna Perämeren kansallispuisto on huomattavasti strategisemmalla paikalla. Silti puistossa on metsästys sallittu, myös harmaahylkeen. Perämerellä on harmaahylkeen lisäksi ylisuuri itämerennorppakanta.

Hylkeistä on tullut haittalajeja ja niiden kannat lisääntyvät noin kahdeksan prosenttia vuosittain. Hylkeet syövät kalat pyydyksistä ja niiden ympäriltä.