Punkkisota-dokumentissa Joonas Berghäll käy tapaamassa pitkäaikaista borrelioosia sairastavaa Yoan-poikaa Ranskassa.
Joonas Berghällin Punkkisota-dokumentti alkaa pysäyttävästi kohtauksella, jossa Berghäll itse makaa saksalaisen klinikan vuoteella ja valmistautuu vaaralliseen operaatioon. Vielä ennen nukutusta hän lähettää terveiset kummipojalleen ja ilmoittaa jättävänsä kaiken yhtiökumppanilleen, jos jokin menee pieleen.
Kronologisesti elokuvan keskivaiheille ajoittuvan kohtauksen jälkeen pohjustetaan, miten tilanteeseen on päädytty.