Geenitutkimuksen nykykäsityksen mukaan valtaosalla ihmiskuntaa on neandertalinihmiseltä saatua perimää. Kahden ihmislajin katsotaan risteytyneen Lähi-idässä tai Euroopassa sen jälkeen, kun Afrikasta lähtenyt nykyihminen saapui alueelle noin 40 000 vuotta sitten.

Tämä selittäisi sen, miksi afrikkalaisilla Saharan eteläpuolella ei ole neandertalien perimää, mutta kaikilla muilla nykyihmisillä sitä on 1–4 prosenttia.