Padot, vesivoimalaitokset ja vedenottamot ovat suurin syy sisävesilajien uhanalaisuudelle, ilmenee uhanalaisten lajien suojelun toimintaohjelmasta. Sen mukaan vesirakentaminen vaikuttaa rakennetuilla paikoilla, valuma-alueilla ja pohjavesissä. Ohjelman on tehnyt ympäristöministeriön työryhmä.
Suomessa on ohjelman mukaan yli 2 200 uhanalaista lajia, joista yli 130 elää sisävesissä. Elinympäristöstään hyvin riippuvaisia ovat sammakkoeläimet ja kalat. Erityistä huomiota tarvitsisivat saimaannorppa ja jokihelmisimpukka.
Vesirakentamisen lisäksi sisävesilajeja uhkaavat vesien rehevöityminen ja saastuminen.
Haittoja voi vähentää maankäytön suunnittelulla ja kehittämällä maa- ja metsätalouden toimintatapoja, ohjelma kertoo. Ohjelman tavoite on uhanalaisten lajien tilan parantaminen vuoteen 2020 mennessä.