Ruotsi ja Suomi ovat päätyneet yhteisesti otetuista tutkimusnäytteistä erilaisiin johtopäätöksiin Perämeren veden laadusta.
Ruotsalaisten tulkinta Rajajokikomission kolmivuotisen tutkimuksen näytteistä on, että Perämeren veden laatu ei ole kemialliselta statukseltaan hyvä.
Suomalaiset ovat päätyneet samojen näytteiden elohopea-, raskasmetalli- ja pcb-pitoisuuksista johtopäätöksiin, että veden laatu on hyvä.
Ristiriidasta huolimatta onnellisinta on, että tällä veden kemiallista laatua koskevalla erimielisyydellä ei ole mitään merkitystä esimerkiksi Perämeren kaloja syöville.