Utsjoen seurakunnalla on 270-vuotinen historia itsenäisenä seurakuntana. Se perustettiin 1747 ja samalla siihen liitettiin Inari kappeliseurakuntana, joka itsenäistyi 1881. Nyt ollaan palaamassa entisiin aikoihin, sillä Utsjoen seurakuntaa ollaan yhdistämässä Inarin seurakuntaan kappeliseurakuntana.
Syynä on seurakunnan heikentynyt talous, joka johtuu lähinnä Karigasniemen kappelin rakentamiskustannusten ylittymisestä. Kirkkovaltuusto oli varautunut siihen, että rakentaminen maksaa noin miljoona euroa.