Biotalous on ollut otsikoissa sekä hyvässä että pahassa. Biotalous on nähty mahdollisuutena uuteen talouskasvuun ja fossiilisten raaka-aineiden korvaamiseen biopohjaisilla materiaaleilla, lähinnä puulla. Samaan aikaan on kyseenalaistettu metsien lisääntyvä hyödyntäminen - monikäyttöön, luonnon monimuotoisuuteen ja ilmastokysymyksiin vedoten.
Puun käytön lisääntyessä on esitetty huoli luonnon monimuotoisuuden vaarantumisesta. Pelätään, että puun käytön tehostuminen johtaa monimuotoisuuden heikkenemiseen.