Jalkapallon Veikkausliigan hallitus on tehnyt muutoksen Liigacupin edellisvuosien pelimalliin ja vuonna 2016 Liigacup pelataan kahdessa alueellisessa kuuden joukkueen lohkossa. Rovaniemen Palloseura ja PS Kemi pelaavat A-lohkossa yhdessä liigamestari SJK:n, tamperelaisen FC Ilveksen, Kuopion Palloseuran sekä Vaasan Palloseuran kanssa.

Alkulohkojen sisällä joukkueet pelaavat kaikkia vastaan yksinkertaisen sarjan ja lohkovaihe pelataan aikavälillä 17.1.-21.2.